Внешне Fishdom — это классическая головоломка в жанре «три в ряд». Задача игроков — объединить не менее трех одинаковых предметов морской тематики, чтобы очистить игровое поле. В то же время в Fishdom много подводных камней, так что эта головоломка не то, чем кажется.

Каждый уровень необходимо пройти за ограниченное количество ходов, и постепенно сложность возрастает. Например, на поле появляются препятствия вроде золотых цепей, сковывающих фишки. Справиться с ними помогут бустеры, которые можно получить, собрав определенную комбинацию. Так, если объединить пять ракушек, они превратятся в бомбу. Чтобы узнать обо всех подобных секретах, прислушивайтесь к советам мудрой черепахи.

Один из самых интересных элементов игры — аквариумы, стилизованные под тропики, ферму или Древнюю Грецию. В местном магазине для них можно купить дополнительные украшения за монеты, полученные в качестве наград.